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报告的数据可为儿科患者提供新的治疗途径

纽约州纽约市(2020年11月25日)-对涉及小儿脑肿瘤的蛋白质,基因和RNA转录的全面“蛋白质组学”分析,使人们对这些肿瘤有了更全面的了解,这是导致癌症的主要原因-与儿童有关的死亡。该结果可帮助医生更准确地识别不同类型的肿瘤及其治疗方法。

临床蛋白质组学肿瘤分析协会(CPTAC)和儿童脑肿瘤网络(CBTN)的研究人员收集并分析了来自儿童多种类型脑瘤的遗传,基因组和蛋白质组数据。该财团由西奈山伊坎医学院,国家癌症研究所,弗雷德·哈钦森癌症研究中心,儿童国家医院和费城儿童医院的合作者组成。这项研究是第一个针对儿童脑肿瘤的大规模多中心研究,已于11月25日在Cell上在线提供。

该研究的首席作者,西奈山伊坎医学院遗传学和基因组科学教授王培(Pei Wang)博士解释说:“一般来说,小儿癌症,尤其是小儿脑肿瘤,具有较低的突变负担。”“因此,对这些肿瘤的功能分子生物学进行全面表征,包括在这项研究中进行的蛋白质组学分析,对于更好地了解和治疗小儿脑肿瘤至关重要。”

这项研究是对基因组学(旨在表征样品中DNA序列变化的特征),转录组学(旨在量化RNA拷贝的数量),整体蛋白质组学(旨在鉴定和定量蛋白质)和磷酸化蛋白质组学(用于量化)的首次全面调查。活性蛋白)涵盖了代表七种不同类型脑肿瘤的218个肿瘤样本。

通过表征这些不同类型的肿瘤之间共有的生物学主题,该研究揭示了新的见解,表明当前针对特定肿瘤类型使用的治疗方法可以应用于具有相同蛋白质组学特征的其他治疗方法。具体而言,分析发现小儿颅咽管瘤是一种小儿脑肿瘤,分为两个不同的亚组。一个亚组显示出与另一类肿瘤(称为“具有BRAFV600E突变的低级神经胶质瘤(LGG))”相似的蛋白质组/磷酸化特征。该观察结果表明,MEK / MAPK抑制剂(一种已用于治疗带有BRAFV600E-LGG突变的LGG的化学疗法)可能也可以帮助治疗目前尚无可靠化学疗法选择的小儿颅咽神经瘤。

“这项联合研究的推动力是对数据共享和开放科学的承诺。在一起使CPTAC和CBTN都有机会扩展我们的资源来回答至关重要的生物学问题。利用这些联合体的集体专业知识使我们能够以便更好地了解儿科肿瘤的机制,改善靶蛋白的鉴定过程,并可能改善癌症的治疗方法,” CBTN科学联席主席,CBTN数据驱动发现中心主任,Adam Resnick博士说。费城儿童医院的生物医学(D3b)。

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